文件名称:petcmodel:衣藻光合电子传递链模型
文件大小:28KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-23 05:25:36
Python
光合电子传递链模型 模型 我们共享 Python 文件,该文件再现了 Ebenhoeh 等人发表的论文中描述的数学模型。 2014 年,最初在 MATLAB 中开发该模型包括一组七个耦合常微分方程,并捕获了模式生物藻类莱茵衣藻的主要蛋白质复合物和光合光React关键产物的时间演变。 这些方程在 petcModel.py 中实现,它们的来源在出版物的电子补充材料中有详细解释。 lightProtocol.py:包括几个模拟所需的光照函数 parametersPETC.py:存储所有参数 misc.py:包含两种额外的方法来计算腔内 pH 值 模拟.py:包括积分方法和计算稳态的方法,也基于绝对误差容限 petcResults:帮助复制出版物中包含的一些数字的附加文件 出版物 Ebenhoeh, O., Fucile, G., Finazzi, G., Rochaix, JD & Golds
【文件预览】:
petcmodel-master
----.gitignore(3B)
----README.MD(4KB)
----steadyStateAnalysis.py(3KB)
----requirements.txt(149B)
----petcModel.py(11KB)
----petcResults.py(5KB)
----dld.py(2KB)
----lightProtocol.py(3KB)
----LICENSE(28KB)
----misc.py(851B)
----simulate.py(5KB)
----anoxia.py(3KB)
----parametersPETC.py(7KB)