文件名称：NCLDV_Biogeography：与Endo等人相关的代码。 2020年，自然生态与进化
文件大小：2.16MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-01 20:47:37
Python
NCLDV_生物地理 与Endo等人相关的代码。 2020年，自然生态与进化 该git存储库包含用于为以下手稿生成NCLDV的规范化丰度配置文件的文件和脚本 Biogeography of marine giant viruses reveals their interplay with eukaryotes and ecological functions by Endo H, Blanc-Mathieu R, Li Y, Salazar G, Henry N, Labadie K, de Vargas C, Sullivan MB, Bowler C, Wincker P, Karp-Boss L, Sunagawa S & Ogata H Nature Ecology & Evolution, 2020, doi:https://www.nature.com/articles/s41
【文件预览】：
NCLDV_Biogeography-master
----data()
--------RAxML_info.pplacer.txt(2KB)
--------RAxML_result.pplacer.nwk(17KB)
--------PolB_NCLDV_table.txt(8.69MB)
--------pplacer_ref211.msa(2.34MB)
----README.md(2KB)
----scripts()
--------ncldv_stdz.R(3KB)
--------parse_jplace.py(3KB)
--------extract_target_line.py(1KB)
--------run_pplacer.sh(1KB)