文件名称:matlab终止以下代码-BJS:使用BJS的HCPD-MRI数据分析管道
文件大小:130.4MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-10 04:11:50
系统开源
matlab终止以下代码代码库和软件要求 维护者:黄成龙() 代码库说明 代码库保留在中。 数据:在/ data文件夹中: D-MRI数据: SLF_L_data.nii.gz :左半球中SLF的合成图像(原始信号加上人为的小噪声) bvals :b值 bvecs :梯度方向 牵引口罩: SLF_L.nii.gz , SLF_R.nii.gz :来自JHU概率白质体谱地图集的ROI(每个半球上纵筋膜)的蒙版。 SLF_L_seed.nii.gz,SLF_R_seed.nii.gz,SLF_L_target.nii.gz,SLF_R_target.nii.gz:从AutoPtx SLF流线型选择口罩。 估计的FOD的提取峰:跟踪算法的输入peaks.mat 示例脚本:在/ example_scripts文件夹中: example_simulation_fib2.py :模拟示例–真正的FOD有两个峰值 example_simulation_fib3.py :模拟示例–真正的FOD具有三个峰值 example_plot_fod.m :Matlab脚本以绘制估计的FOD example_HC
【文件预览】:
BJS-master
----man()
--------roi0.png(1.11MB)
--------t2_seg.png(31KB)
--------SLF_registration.png(257KB)
--------roi1.png(2.04MB)
--------connectome.png(271KB)
--------SLF_L_colormap.png(125KB)
--------SLF_tractography.png(344KB)
--------roi3.png(1.54MB)
--------T1w_seg.png(126KB)
--------~$P_analysis_Pipeline.docx(162B)
--------bet_t2_mask.png(154KB)
--------SLF_tract2.png(228KB)
--------.Rhistory(2KB)
--------seed_info.png(436KB)
--------manual.Rmd(27KB)
--------pipeline.png(689KB)
--------.DS_Store(6KB)
--------roi2.png(1.24MB)
--------manual.html(11.13MB)
----README.md(28KB)
----matlab()
--------fod_plotting()
--------.DS_Store(8KB)
----example_scripts()
--------example_simulation_fib2.py(11KB)
--------example_HCP_tractography.R(3KB)
--------example_plot_fod.m(3KB)
--------example_HCP_analysis.py(10KB)
--------.Rhistory(2KB)
--------example_simulation_fib3.py(13KB)
--------.RData(2.79MB)
--------.DS_Store(6KB)
--------example_HCP_dMRI_download_preprocess.R(6KB)
----.Rhistory(12B)
----.DS_Store(18KB)
----data()
--------peak.mat(50.08MB)
--------SLF_L.nii.gz(22KB)
--------SLF_R.nii.gz(20KB)
--------slf_l.png(143KB)
--------SLF_L_target.nii.gz(15KB)
--------bvals(1KB)
--------subjects.txt(1KB)
--------tracts_SLF_L.Rdata(64.65MB)
--------bvecs(9KB)
--------SLF_L_seed.nii.gz(15KB)
--------SLF_L_data.nii.gz(48.78MB)
--------view_left_slf.Rdata(152B)
--------.DS_Store(6KB)
--------SLF_R_seed.nii.gz(15KB)
--------SLF_R_target.nii.gz(15KB)
----python()
--------sphere_mesh.py(5KB)
--------dwi_simulation.py(15KB)
--------FOD_peak.py(4KB)
--------sphere_harmonics.py(6KB)
--------.DS_Store(6KB)
--------fod_estimation.py(7KB)
--------fod_HCP_application.py(6KB)
----README.Rmd(28KB)