文件名称：rnaseq-data-analysis-ARCHIVED
文件大小：32.04MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-17 13:32:11
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布局 页 RNA-seq数据分析 这次关于RNA-seq数据分析的研讨会面向没有统计学或生物信息学经验的生命科学家。 第一部分（质量控制，比对和计数）使用BRB数字基因表达（BRB-DGE， ）工具。 它以FASTQ格式的RNA序列数据文件作为输入，并以文本格式输出原始计数数据。 第二部分（差异表达分析）假定您对R基本熟悉。 数据 样本数据文件夹中提供了一个大小有限的FASTQ数据样本。 学生应使用此数据遵循练习。 练习结束后，鼓励学生从公共存储库ArrayExpress或类似版本中下载自己的数据，并在完整数据集上重复学到的概念。 要从ArrayExpress（ ）下载数据，请单击“浏览”并按实验类型“ RNA assay”和“ Sequencing assay”过滤搜索结果。 下载包含FASTQ格式的原始数据的数据集。 目标 在研讨会结束之前，参与者将：（1）知道如何将基因表达与RN
【文件预览】：
rnaseq-data-analysis-ARCHIVED-gh-pages
----02-differential-expression.md(19KB)
----README.html(634KB)
----CONTRIBUTING.md(3KB)
----LICENSE.md(3KB)
----README.md(2KB)
----02-differential-expression.Rmd(17KB)
----Makefile(523B)
----01-alignment-counting.md(15KB)
----01-alignment-counting.html(648KB)
----data()
--------coldata.csv(40KB)
--------ctl3.fastq.gz(3.39MB)
--------uvb1.fastq.gz(7.41MB)
--------ctl2.fastq.gz(3.54MB)
--------uvb3.fastq.gz(7.07MB)
--------samples.txt(173B)
--------ctl1.fastq.gz(3.11MB)
--------counts.txt(372KB)
--------uvb2.fastq.gz(6.99MB)
----.gitignore(9B)