阅读中的引物

时间:2024-03-03 21:22:32
【文件属性】:

文件名称:阅读中的引物

文件大小:2KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-03-03 21:22:32

Python

搜索读物中的引物 bbduk_search_for_primers.py自述文件 依存关系 python3 python-dev(sudo apt-get安装python-dev),bbduk.sh(可以使用conda安装- conda install -c bioconda/label/cf201901 bbmap) 或者,可以通过从以下位置下载源代码来本地安装: https://github.com/BioInfoTools/BBMap/blob/master/sh/bbduk.sh 目标 search-primers-in-reads.py是一个使用python语言的脚本,旨在自动执行读取中的搜索引物序列。 该脚本使用.txt文件中的引物列表来仅提取读物,并且在读物的两面都有引物。 输入 带有引物的输入文件应具有.txt扩展名 示例:primers_file.txt 引物格式


【文件预览】:
search-primers-in-reads-main
----bbduk_search_for_primers_in_reads.py(2KB)
----README.md(2KB)

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