文件名称：gffcompare：通过与参考注释GFF进行比较来对GFF文件进行分类，合并，跟踪和注释
文件大小：71KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-03 07:47:49
C++
Gff比较 比较并评估RNA-Seq转录组装体（袖扣，细绳）的准确性。 折叠（合并）来自多个GTF / GFF3文件的重复成绩单（例如，来自不同样品的组装） 对一个或多个GTF / GFF3文件中的笔录进行分类，因为它们与注释文件中提供的参考笔录有关（也为GTF / GFF3格式） 可以在以下文章中找到更多详细信息和用法示例： ，也可以引用该软件。 可在此处在线找到此实用程序的官方文档和下载包： : 有关GffCompare期望的GFF3 / GTF文件格式的更多信息，请参考可用的在线文档-可以在以下位置找到快速查看： : 该程序的原始版本作为Cufflinks套件的一部分分发，名称为“ CuffCompare”。 GffCompare仍支持CuffCompare的整体功能和大多数选项，而仅将新功能添加到GffCompare中，因为它是程序的积极维护。 GffCo
【文件预览】：
gffcompare-master
----prep_source.sh(658B)
----trmap.cpp(12KB)
----gffcompare.cpp(97KB)
----gtf_tracking.h(47KB)
----tag_git.sh(310B)
----examples()
--------output()
--------annotation.gff(29KB)
--------README.md(945B)
--------transcripts.gtf(2KB)
----LICENSE(1KB)
----prep_linux.sh(673B)
----prep_mac.sh(448B)
----GIntervalTree.h(3KB)
----README.md(5KB)
----Makefile(2KB)
----GIntervalTree.cpp(17KB)
----gtf_tracking.cpp(30KB)