exonerate-gff3:通过添加 gff3 支持免除 fork

时间:2024-07-07 17:46:06
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文件名称:exonerate-gff3:通过添加 gff3 支持免除 fork

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更新时间:2024-07-07 17:46:06

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无罪-gff3 这是一个增加了 gff3 支持的无罪分叉。 带有用户指南的原始网站: : 新选项:--gff3 [假] 将“--gff3 yes”选项与“--showtargetgff yes”选项一起使用将输出 GFF3。 如果没有“--gff3 yes”选项,一切都像以前一样工作,因此以前依赖旧输出格式的脚本不会中断。 示例命令: exonerate -q protein.fa -t genome.fa --model protein2genome --querytype protein --targettype dna --showvulgar no --softmaskquery yes --softmasktarget yes --minintron 20 --maxintron 3000 --showalignment no --showtargetgff yes


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