文件名称:java8看不到源码-PRSoS:PRS-on-SPARK
文件大小:1.94MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-24 13:31:27
系统开源
java8 看不到源码PRS-on-Spark PRS-on-Spark (PRSoS) 为大型基因型数据生成多基因风险评分 (PRS),包括推算的基因型后验概率。 它可以使用多个内核来提高处理效率(即减少处理时间)。 PRSoS 与 Linux、Mac OS 和 Windows 兼容。 它使用和运行。 联系信息 劳伦斯·陈: 出版物 如果您在任何已发表的作品中使用 PRSoS,请引用描述方法的手稿: Chen, LM, Yao, N., Garg, E., Zhu, Y., Nguyen, TTT, Pokhvisneva, I., Hari Dass, S., Unternaehrer, E., Gaudreau, H., Forest, M., McEwen , LM, MacIsaac, JL, Kobor, MS, Greenwood, CMT, Silveira, PP, Meaney, MJ, O'Donnell, KJ (2018)。 PRS-on-Spark (PRSoS):一种新颖、高效且灵活的生成多基因风险评分的方法。 BMC 生物信息学, 19 , 295.
【文件预览】:
PRSoS-master
----.gitignore(18B)
----README.md(26KB)
----examples()
--------example_commands.sh(500B)
--------example.gen(108KB)
--------output()
--------example.vcf(281KB)
--------gwasfile.txt(5.89MB)
--------example.sample(5KB)
----PRSoS.py(41KB)
----requirements.txt(36B)