文件名称：直流偏置的matlab代码-decipherMutationalSignatures:使用替代算法解密突变特征
文件大小：20.42MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-09 17:06:24
系统开源
直流额定的matlab代码解密在癌症中起作用的突变特征的管道 使用替代算法解密突变特征。 基于先前出版物（Alexandrov LB等）的源代码对变异签名进行解密，但提供了更简单的命令行来运行。 此外，它还提供了其他几种算法。 该程序是通过mcc编译的二进制代码，因此您可以使用MCR（免费提供）运行它。 该程序已通过MCR_R2013a进行了测试。 Alexandrov LB，Nik-Zainal S，Wedge DC等：解密在人类癌症中起作用的突变过程的特征。 细胞代表3：246–59，2013年 Alexandrov LB，Nik-Zainal S，Wedge DC等：人类癌症中突变过程的特征。 自然500：415–21，2013 检查“ example.sh”以查看如何运行该程序。 提供用于运行example.sh的数据文件已发布在： Li X.，Wu，WKK，Xing R.，Wong，SH，＆Liu，Y.（2016年）。 通过分子表征确定的胃癌的独特亚型包括具有预后能力的新型突变特征。 癌症研究。 完成运行example.sh时，将生成一个“输出”目录，所有结果都放置在此目录中
【文件预览】：
decipherMutationalSignatures-master
----example.sh(2KB)
----types.txt(384B)
----decipherMutationalSignatures_v1(60KB)
----originalGenomes.txt(105KB)
----decipherMutationalSignatures_v1.ctf(21.91MB)
----run_decipherMutationalSignatures_v1.sh(1KB)
----sampleNames.txt(14KB)
----README.md(3KB)
----subtypes.txt(384B)