文件名称:oliver:固执己见的克伦威尔编排经理
文件大小:665KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-17 19:06:31
workflow bioinformatics genomics hpc next-generation-sequencing
奥立佛 固执己见的克伦威尔编排经理。 · · :star: 考虑为回购加注星标! :star: :artist_palette: 特征 工作流编排。 在Cromwell环境中轻松提交,检查,取消和重试工作流。 更好的工作跟踪。 作业可以与名称和作业组相关联,以实现更好的状态报告。 动态参数解析。 在命令行上指定输入和选项,而不是编辑JSON文件。 第三方云集成。 使用aws和azure子命令来探索特定于云的功能。 :books: 入门 安装 conda Oliver是使用社区策划的Anaconda存储库conda-forge打包分发的。 您需要安装 conda ,我们建议您首先按照conda-forge 文档中的说明进行设置! conda install oliver -c conda-forge Python 包索引 您还可以使用 Python 包索引 ( PyPI ) 安装 Oliver。 pip install stju
【文件预览】:
oliver-master
----Dockerfile(586B)
----.gitignore(2KB)
----README.md(8KB)
----.github()
--------workflows()
--------ISSUE_TEMPLATE()
----.pre-commit-config.yaml(486B)
----tests()
--------oliver()
----mypy.ini(419B)
----.vscode()
--------extensions.json(88B)
--------settings.json(330B)
----docker-compose.yml(803B)
----mocks()
--------cromwell()
----docs()
--------images()
--------integrations()
--------getting-started()
--------advanced-guides()
----.commitlintrc.yaml(409B)
----stubs()
--------pendulum.pyi(977B)
--------tzlocal.pyi(32B)
----CONTRIBUTING.md(4KB)
----oliver()
--------__init__.py(0B)
--------__main__.py(3KB)
--------subcommands()
--------integrations()
--------lib()
----seeds()
--------seed.sh(446B)
--------wdl()
----codecov.yml(40B)
----mkdocs.yml(697B)
----LICENSE.md(1KB)
----pyproject.toml(2KB)
----RELEASE.md(788B)
----.pylintrc(9KB)
----poetry.lock(129KB)
----package-lock.json(26B)