文件名称：Peptide Pattern Recognition:基于非比对的 DNA 和蛋白质序列分析软件-开源
文件大小：262KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-18 20:45:57
开源软件
用于分析、分组和功能预测 DNA 和蛋白质序列的软件，如：Busk PK (2017) 中所述。 用于高通量蛋白质序列分析和聚类的肽模式识别。 BioRxiv。 doi：https://doi.org/10.1101/181917。 Busk PK 和 Lange L. (2013)。 通过识别短的、保守的肽基序对碳水化合物活性酶进行基于功能的分类。 应用环境微生物。 79（11），3380-91。 Busk PK Lange M. Pilgaard B. 和 Lange L. (2014)。 编码具有相同活性的酶的几个基因对于自然界中纤维素的需氧真菌降解是必需的。 PLoS 一，9，e114138。
【文件预览】：
Peptide_Pattern_Recognition
----make_groups.rb(7KB)
----Busk_2017.pdf(40KB)
----peptide_pattern_recognition.rb(16KB)
----delete_peps_w_score_1.rb(3KB)
----GH117()
--------GH117_unique_sequences.txt(49KB)
----rank_seed_proteins.rb(3KB)
----PPR instructions.pdf(77KB)
----MAPK()
--------MAPK_unique_sequences.txt(418KB)