文件名称：miaViz:微生物组分析绘图和可视化
文件大小：95KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-08 11:14:30
visualization bioconductor plotting microbiome microbiome-analysis
miaViz 微生物组分析绘图和可视化 该软件包的范围是微生物组数据的绘制和可视化。接口的主要类是TreeSummarizedExperiment类。 贡献 随意通过分叉和打开拉取请求来做出贡献。请确保将所需的数据整理设计为尽可能可重用，并可能在包中找到更好的家。 此外，请确保包含了工作示例，并且miaViz晕了使用miaViz或软件包中的附加功能。 技术方面 让我们使用一种git flow方法。开发版本应该对进行master分支，然后合并到release的释放。 （ ） 行为守则 请注意，miaViz项目是与“参与者。通过为该项目做贡献，您同意遵守其条款。
【文件预览】：
miaViz-master
----miaViz.Rproj(343B)
----.gitignore(44B)
----NAMESPACE(3KB)
----vignettes()
--------.gitignore(11B)
--------miaViz.Rmd(9KB)
----R()
--------plotSeries.R(12KB)
--------utils_plotting.R(9KB)
--------treeData.R(8KB)
--------plotPrevalence.R(22KB)
--------plotTree.R(58KB)
--------miaViz.R(2KB)
--------plotAbundance.R(19KB)
--------plotGraph.R(25KB)
--------utils.R(2KB)
----data()
--------row_graph.rda(23KB)
--------col_graph.rda(1KB)
--------row_graph_order.rda(3KB)
----.Rbuildignore(52B)
----LICENSE(9KB)
----.github()
--------.gitignore(7B)
--------workflows()
----man()
--------plotTree.Rd(8KB)
--------treeData.Rd(2KB)
--------plotGraph.Rd(7KB)
--------plotAbundance.Rd(4KB)
--------miaViz-package.Rd(433B)
--------mia-datasets.Rd(1KB)
--------plotSeries.Rd(3KB)
--------plotPrevalence.Rd(6KB)
----README.md(1KB)
----tests()
--------testthat.R(56B)
--------testthat()
----DESCRIPTION(1KB)
----pkgdown()
--------_pkgdown.yml(73B)
--------extra.css(38B)