文件名称：NICU_Microbiome_Study:微生物组分析和相关数据
文件大小：1.54MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-04 03:16:02
重症监护病房_微生物组_研究 微生物组分析和相关数据。 此回购包含手稿“表征非常早产儿的细菌肠道微生物组”的补充数据。 这包括： 完整的工作流程，从原始读取到分析。 元数据（已标识）。 元数据摘要。 对于上下文，以下是本研究中使用的方法的摘要。 实验室规程 使用Bioline ISOLATE粪便DNA试剂盒进行DNA提取，并与制造商协商进行修改以优化DNA产量。 这包括增加β-巯基乙醇（从0.5％到1％，以增加DNA溶解度并减少二级结构的形成），增加额外的洗涤步骤（以提高纯度）和减少洗脱缓冲液体积（以增加最终DNA浓度）。 对于文库制备，我们使用Index Kit v2 C和Platinum:trade_mark:SuperFi:trade_mark:PCR Master Mix遵循Illumina宏基因组学文库制备方案。 对于测序，我们将MiSeq试剂盒V3与Illumina MiSeq系统结合使用，以785F /
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NICU_Microbiome_Study-main
----Complete_Workflow_NICU_Microbiome.Rmd(68KB)
----Additional_File_2.csv(937B)
----LICENSE(1KB)
----NICU_metadata.csv(21KB)
----README.md(8KB)
----Complete_Workflow_NICU_Microbiome.pdf(1.72MB)