文件名称：semiautocount:基于交互式培训计数类型的细胞在血液涂片
文件大小：68.36MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-15 10:20:08
Python
疟原虫自动计数和半自动计数 Plasmodium Autocount 是一个 Python 脚本，用于对血液涂片上感染疟疾的血细胞进行计数。 随着 VBC 的关闭和 VBC 网站 vicbioinformatic.com 的不确定未来，Plasmodium Autocount 代码保留在此处： Semiautocount 旨在作为 Plasmodium Autocount 的新版本，结合手动注释细胞的机器学习。 目标是根据交互式训练计算血涂片中的细胞类型，例如测量疟疾感染的阶段和严重程度。 Semiautocount 的开发被搁置，可能是永久的。 代码功能正常，但没有经过太多调整。 特别是有相当大的空间来扩展用于分类细胞的测量集。 这是在 GPL 版本 2 许可下分发的免费软件。 要求 Python 2 Python包： 麻木的 scipy scikit-image（需要 n
【文件预览】：
semiautocount-master
----.gitignore(544B)
----README.md(4KB)
----LICENSE(18KB)
----semiautocount()
--------configure.py(2KB)
--------autocount_workspace.py(2KB)
--------report.py(2KB)
--------util.py(2KB)
--------importer.py(2KB)
--------images.py(3KB)
--------__init__.py(633B)
--------__main__.py(77B)
--------segment.py(9KB)
--------classify.py(2KB)
--------measure.py(2KB)
--------stats.py(2KB)
--------templates()
--------serve.py(9KB)
----setup.py(1KB)
----autocount()
--------plasmodium-autocount-0.1.py(19KB)
--------README.md(2KB)
--------sample-images.zip(67.43MB)
--------autocount-output-sample.png(40KB)
--------Cell Counting Aid Source.zip(689KB)
--------Cell Counting Aid.zip(214KB)