文件名称:下采样matlab代码-threshDet:GUI,用于检测采样系列中的事件(例如尖峰)
文件大小:8.06MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-14 03:07:51
系统开源
下采样matlab代码阈值 是用于按时间序列检测神经元信号的图形用户界面。 要检测的信号可以是持续时间固定的事件(例如动作电位),也可以是突发脉冲的事件(例如持续时间不定的突发事件)。 该代码将内部格式用于时间信息,即“时间戳列表”(tsl)和“扩展时间戳列表”(etsl)。 特征: 读取各种格式的文件(目前为Axon二进制格式(abf),由MultiChannelSystems(* .mcd)文件转换产生的HDF5,自定义Matlab格式) 预处理时间序列的多种方式(去除伪影;高通,低通,陷波和微分滤波器;上采样和下采样;用于自定义命令的接口) 基于阈值的事件和突发检测算法 可选自动将阈值水平调整为基线噪声 检查和清除单个事件 通过PCA对事件进行排序 事件检测的批处理模式 保存到磁盘的时间戳,检测到的事件/突发摘要以及预处理的时间序列 有关插图的介绍,请参见manual_threshdetgui.pdf 。 请注意,该存储库中的代码不是自给自足的,您还需要以下存储库: 文件IO 埃斯特芬奇 图形 sampledSeries 公用事业 需要的Matlab工具箱: 信号处理 统计与机器
【文件预览】:
threshDet-master
----parameterFiles()
--------IPSC_differentiatorFIR.fig(39KB)
--------EPSC_differentiatorFIR.fig(39KB)
--------mp.fig(39KB)
--------ExpAn_spx_default.fig(40KB)
--------spx_intra.fig(39KB)
--------ExpAn_IPSC_default.fig(40KB)
--------PSC_burstDetect.fig(39KB)
--------spx.fig(39KB)
--------MUA.fig(39KB)
--------fp.fig(39KB)
----.gitattributes(196B)
----private()
--------callbackfn_rawovplot.m(6KB)
--------setThreshInfoText.m(479B)
--------callbackfn_rawexcplot.m(13KB)
--------threshdetguifunc.m(67KB)
--------cutdealgui.m(5KB)
--------cutdealguifunc.m(12KB)
--------threshdet_optgui.m(22KB)
----doc()
--------manual_threshdetgui.pdf(4.22MB)
--------screenshot_threshDet.png(326KB)
--------versions.rtf(176KB)
----.gitignore(9B)
----readme.md(3KB)
----threshdetgui.m(7KB)
----exampleData()
--------testabf2.abf(4.62MB)
----license.txt(1KB)