文件名称:matlab分时代码-dMI:dMI
文件大小:1.41MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-10 13:11:51
系统开源
matlab分时代码dMI 用于量化生化信号通道信息积累的软件包。 (c)UCLA 2020信号系统实验室版权所有。 该MATLAB代码包对时间序列数据的动态互信息进行量化。 它使用时间非均匀马尔可夫模型或隐马尔可夫模型来学习时间序列集的动力学模式。 然后,它可以通过对相同数量的时间序列进行采样来重现路径集合,并量化数据和采样之间的相似度。 它还进一步计算每个时间序列的轨迹概率以及动态的互信息。 正文中提供了有关这些方法的详细示例。 联系人︰唐英 指导方针 软件包的网站上提供了分步指南:。 接受手稿后,网站链接可能会有所不同。 系统要求:所有仿真均使用MATLAB:registered:版本R2019a完成。 我们在MATLAB中使用了工具箱“隐马尔可夫模型(HMM)”。 第三方软件包: (1)用于在上生成NFkB数据的程序包。 (2)感谢Roy Wollman小组分享了向量方法的代码。 (3)这里不包括基于解码的方法,因为它可以由用户友好的包()单独实现。 预期运行时间:以下所有预期运行时间均基于具有3.7GHzintel:registered:core(tm)i7-8700 CPU的个人台式机进行评估。
【文件预览】:
dMI-master
----package()
--------weightedStats.m(5KB)
--------MarkovDistance.m(24KB)
--------showdoc.m(511B)
--------maketicks.m(3KB)
--------mysigstar.m(2KB)
--------getInfo_Previous.m(2KB)
--------MostProbable.m(911B)
--------PlotCC.m(13KB)
--------HMMDistance.m(27KB)
--------setopts.m(6KB)
--------example_HMM.m(14KB)
--------plotSpread.m(20KB)
--------isEven.m(813B)
--------Markov_partition.m(10KB)
--------smoothHistogram.m(7KB)
--------HMMStatistics.m(15KB)
--------PermDataInputOrder.m(240B)
--------README.pdf(64KB)
--------divergingmap.m(8KB)
--------jacknifeCC.m(3KB)
--------HMMTrain.m(6KB)
--------JackknifeCCMarkov.m(3KB)
--------linspecer.m(8KB)
--------nfkbmetrics.m(11KB)
--------Partial_Statistics.m(25KB)
--------PointWiseOptim.m(2KB)
--------countEntries.m(4KB)
--------VectorMethod.m(2KB)
--------ann_mex.mexmaci(68KB)
--------getCC_Previous.m(6KB)
--------MMStatistics.m(8KB)
--------LogP.m(817B)
--------getCCMarkov.m(10KB)
--------colorCode2rgb.m(882B)
--------data1.mat(1.11MB)
--------construct_mi_mat.m(829B)
--------example_HMM_Partition.m(17KB)
--------distinguishable_colors.m(6KB)
--------inforun.m(6KB)
--------Partial_Train.m(2KB)
--------Plot_Goodness.m(23KB)
--------smoothrows.m(811B)
--------repeatEntries.m(3KB)
--------loadnfkb.m(3KB)
--------colormapStack.m(5KB)
--------ann_mex.mexmaci64(66KB)
--------PermData.m(4KB)
--------KLDiv.m(1KB)
--------getInfoModelMarkov.m(2KB)
--------color_line3.m(1KB)
--------getInfoHMM_New.m(8KB)
--------HMMPlotting.m(17KB)
--------globalpeaks.m(2KB)
--------HistogramData.m(2KB)
--------LoadDataset.m(7KB)
--------suplabel.m(3KB)
--------condProb.m(3KB)
--------ann_mex.mexw32(52KB)
--------conditional_probabilities_bin.m(2KB)
--------TestCode.m(76B)
--------Violin.m(14KB)
--------ann_mex.mexw64(46KB)
--------annquery.m(14KB)
--------ann_mex.mexa64(61KB)
--------Markov.m(13KB)
--------ann_mex.cpp(9KB)
--------Main.m(7KB)
--------myErrorbar.m(7KB)
--------violinPlot.m(36KB)
----LICENSE.txt(1KB)
----README.md(2KB)