文件名称：genesets:基因集为R环境
文件大小：16.22MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-28 19:01:50
R
基因集为R环境 R环境变量的基因集（例如同一途径内的基因），以便在不同的基因集之间轻松切换。 用法 load('my_env.RData') pathways <- ls(my.env) genes.in.pathway1 <- get(pathways[1], env=my.env) genes.in.pathway2 <- get(pathways[2], env=my.env) 例子 > load('GO_Hs_GS.RData') > ls() [1] "GO.GS2Name" "GO.Hs.ENSEMBL2GS" "GO.Hs.GS2ENSEMBL" "GO.Hs.GS2Symbol" [5] "GO.Hs.Symbol2GS" > gos <- ls(GO.Hs.GS2Symbol) > head(gos) [1] "GO:0000002" "GO:000001
【文件预览】：
genesets-master
----msigdb.v5.0.symbols.gmt(8.93MB)
----CPDB_Hs_GS.RData(510KB)
----GO_Hs_GS.RData(6.8MB)
----gmt2gs.R(869B)
----README.md(2KB)
----MSigDB_Hs_GS.RData(5.33MB)