文件名称：CompBio_miniproject
文件大小：1.73MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-25 20:39:33
Python
CompBio_miniproject 软件下载Kallisto酒店- Biopython - Bowtie2 - SPades- //cab.spbu.ru/software/spades/ 提供的文件：test_code.py：如果使用提供的测试数据，则要运行的代码 SRR __。1_1.fastq文件：成对末端读取的fastq文件的4个SRR编号，与测试代码一起使用 full_code.py：如果使用您自己的SRR编号，则运行代码（请参阅如何使用） sequence.fasta：Herpesvirinae家族的fasta文件，用于建立用于Blast查询的数据库 sleuth.r：运行sleuth的R脚本 makesampleid.r：R脚本，用于制作侦探所需的样本id表 miniproject.log：运行结果记录 如何使用： 要从您自己的终端运行该程序，请使用命令g
【文件预览】：
CompBio_miniproject-main
----test_SRR5660045.1_2.fastq(178KB)
----test_SRR5660044.1_2.fastq(179KB)
----test_SRR5660044.1_1.fastq(179KB)
----test_SRR5660033.1_1.fastq(182KB)
----sleuth.r(767B)
----test_SRR5660045.1_1.fastq(178KB)
----test_SRR5660033.1_2.fastq(182KB)
----full_code.py(9KB)
----makesampleid.r(478B)
----miniproject.log(4KB)
----test_SRR5660030.1_1.fastq(182KB)
----test_SRR5660030.1_2.fastq(182KB)
----sequence.fasta(4.23MB)
----README.md(2KB)
----test_code.py(9KB)