alignTools.C:序列比对（C）的实现

【文件属性】：

文件名称：alignTools.C:序列比对（C）的实现

文件大小：145KB

文件格式：ZIP

更新时间：2024-06-08 03:50:06

C

alignTools alignTools是用于逐对DNA序列比对的C实现工具的集合。 它包括以下对齐功能： 整体一致性 局部语言 适合对齐（跳跃状态） 重叠对齐 编辑距离 不久的将来将添加更多功能。 版本 0.7.23-r15 开始使用 安装 $ git clone [e-mail]:r3fang/alignTools.git $ cd alignTools $ make $ ./bin/alignTools Program: alignTools (pairwise DNA sequence alignment) Version: 0.7.23-r15 Contact: Rongxin Fang Usage: alignTools [options] Command: global global

【文件预览】：
alignTools.C-master
----.gitignore(14B)
----Makefile(93B)
----src()
--------alignment.h(32KB)
--------kstring.c(7KB)
--------kstring.h(7KB)
--------main.c(2KB)
--------kseq.h(9KB)
----README.md(3KB)
----img()
--------global_local_fit_overlap_REP.png(24KB)
--------global_local_fit_overlap.png(24KB)
--------fit_affine_jump_2genes.pdf(73KB)
----test()
--------test_fit.fa(33KB)
--------tmp.fa(113KB)
--------test_edit.fa(1KB)
--------test_global.fa(159B)
--------test_local.fa(42B)