文件名称：非负矩阵分解matlab代码-ntc_CNMF:源头分离
文件大小：14.63MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-02 11:43:29
系统开源
非负矩阵划分matlab代码该代码实现了一种方法（约束非负矩阵分解，CNMF），用于从大规模钙成像电影中同时提取源。 此处更详细地介绍了该算法： CNMF 代码由 Eftychios A. Pnevmatikakis 和 Liam Paninski 编写，输入来自 Weijian Yang 和 Darcy S. Peterka。 它们也存储在 . 演示脚本由 Eftychios A. Pnevmatikakis、Liam Paninski、Weijian Yang 和 Darcy S. Peterka 编写，2015 年。 请首先从以下位置下载并安装 cvx matlab 包 使用“demo_script2.m”运行 CNMF 算法。 “demoMovie.tif”是代码演示的钙片图像电影。 运行“demo_script2.m”后，使用“dataProcessing.m”提取结果。 “dataProcessing.m”可以保存一个包含 CNMF 参数和结果的 .mat 文件。 使用“file_dataProcessing.m”从保存的 .mat 文件重新加载结果。
【文件预览】：
ntc_CNMF-master
----plot_contours.m(3KB)
----f_view_patches_mod.m(2KB)
----lagrangian_foopsi_temporal.m(987B)
----.gitattributes(378B)
----f_calDfof.m(473B)
----threshold_components.m(1KB)
----lars_regression_noise.m(7KB)
----file_dataProcessing.m(2KB)
----f_plotActivityTrace.m(1KB)
----merge_ROIs.m(4KB)
----view_patches.m(2KB)
----greedyROI2d.m(5KB)
----f_find_centroid.m(328B)
----arpfit.m(6KB)
----correlation_neighborhood.m(719B)
----graph_conn_comp_mex.mexw64(9KB)
----plain_foopsi.m(1KB)
----MCEM_foopsi.m(5KB)
----bigread2.m(4KB)
----f_unsaturatedPixelFinder.m(475B)
----f_plot_raw_ROIContour.m(637B)
----demoMovie.tif(18.56MB)
----greedyROI2d_multiscale.m(8KB)
----f_signalExtraction_dfof.m(3KB)
----update_spatial_components2.m(5KB)
----data_writeNMF.m(1KB)
----correlation_image.m(2KB)
----f_plotROIContour.m(955B)
----README.md(985B)
----interp_missing_data.m(744B)
----graph_conn_comp_mex.cpp(3KB)
----update_temporal_components.m(5KB)
----update_spatial_components.m(5KB)
----make_patch_video.m(4KB)
----com.m(290B)
----graph_connected_comp.m(693B)
----make_G_matrix.m(263B)
----dataProcessing.m(2KB)
----order_ROIs.m(589B)
----demo_script2.m(12KB)
----greedyROI2d_ROIList.m(6KB)
----file_view_patches_mod.m(2KB)
----cvx_foopsi.m(1KB)
----license.txt(18KB)
----tiff_reader.m(283B)
----constrained_foopsi.m(13KB)