文件名称：matlabrandi函数源代码-MCSS:社会保障部
文件大小：13KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-09 00:33:52
系统开源
matlab randi函数源代码#MCSS 癌症的特点是有许多体细胞突变，然而，只有一部分突变，称为驱动突变，有助于肿瘤的生长和进展。 含有驱动突变的基因和通路分别称为驱动基因和驱动通路。 最近的研究表明，驱动通路中的突变通常出现在大多数样本中，而对于任何样本，只出现一个或几个突变，因为单个突变能够扰乱整个通路。 基于这些发现，开发了一种称为最小成本子集选择 ( MCSS ) 的新方法，用于从头发现癌症研究中的驱动突变途径。 特征 我们提供了一种新的算法 MCSS，它基于原始组合优化问题的非凸近似，并具有正则化，用于从头发现变异的驱动路径。 MCSS 旨在发现多个突变的驱动程序通路，而无需预先指定多个通路和/或多个基因。 MCSS 可以灵活地对多种类型的基因组数据进行综合分析。 目前，除了对单个突变数据集的标准分析外，它还可以将一个突变数据集与一个基因表达数据（对于突变数据可能绘制也可能不绘制在同一组受试者上）进行整合。 安装 为了让研究人员更容易地修改和扩展 MCSS，我们特意提供了源代码而不是工具箱。 研究人员可以将源文件复制到他们的工作目录中，也可以使用以下代码添加路径。 源代
【文件预览】：
MCSS-master
----MCSS_CV1.m(3KB)
----MCSS_0.m(734B)
----MCSS.m(3KB)
----MCSS_CV2.m(3KB)
----MCSS_ME.m(4KB)
----README.md(18KB)
----MCSS_ME_CV1.m(3KB)
----MCSS_ME_CV2.m(3KB)