文件名称：gargammel:gargammel是古老的DNA模拟器
文件大小：610KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-28 04:28:59
sequencing metagenomics ancient-dna-sequences sequence-simulator ancient-dna-fragments
gargammel：古代DNA数据集的模拟 gargammel是一组旨在模拟古代DNA片段的程序。 对于古代人参素样品，我们的程序还可以模拟当今人类污染和微生物污染的各种水平。 gargammel的网站可以在这里找到： ://grenaud.github.io/gargammel/ 问题/错误报告/功能要求： 如果您拥有Github帐户，请考虑创建一个问题，这将帮助其他可能遇到相同问题的人。 contact: Gabriel Renaud email: gabriel [dot] reno [ at sign ] gmail.com 我接受新功能的拉取请求。 正在下载： 做一个 git clone --recursive --depth 1 https://github.com/grenaud/gargammel.git 或通过（生物）conda conda inst
【文件预览】：
gargammel-master
----.travis.yml(100B)
----examplesMapDamage()
--------results_LaBrana()
--------results_Ust_Ishim()
----environment.yml(176B)
----exampleSeq()
--------21.bed.gz(78KB)
--------Makefile(3KB)
----LICENSE(34KB)
----src()
--------deamSim.cpp(48KB)
--------misincorporation2prof.cpp(11KB)
--------microbial_fetcher()
--------addMethyl.pl(4KB)
--------sizefreq.size.gz(879B)
--------sizedist.size.gz(56KB)
--------dnacomp.txt(14KB)
--------fasta2fastas.cpp(4KB)
--------adptSim.cpp(11KB)
--------Makefile(1KB)
--------fragSim.cpp(46KB)
--------matrices()
----Makefile(2KB)
----README.md(22KB)
----msprime_chromosomes.py(8KB)
----ms2chromosomes.py(10KB)
----gargammel.pl(47KB)