文件名称:scriptmanager
文件大小:21.43MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-02 22:39:45
bioinformatics ngs-analysis Java
脚本管理员 包含有用的NGS分析脚本的GUI管道。 脚本通常在半描述性选项卡中进行分类,并设计为可以彼此并行运行。 使用ScriptManager的基本绘图功能的教程 打开根目录中可用的ScriptManager-Tutorial.docx 制作说明 (克隆此存储库后): > cd scriptmanager > ./gradlew build 编译后的JAR文件将输出到build/libs目录中。 当前可用的脚本(210106): BAM统计: -BAM统计 对对数统计 -BAM基因组相关 BAM操作: -BAM-BAI索引器 -BAM文件分类器 -BAM删除重复项 -BAM复制合并 -PIP-seq过滤器 BAM格式转换器: -BAM到scIDX -BAM到GFF -BAM到BED -BAM到bedGraph 文件实用程序: -MD5校验和 高峰通话: -基因