文件名称：JCVI Sequence BARcode Designer-开源
文件大小：410KB
文件格式：TGZ
更新时间：2024-08-07 21:57:34
开源软件
编写该软件是为了在使用 454 焦磷酸测序时设计用于样本多路复用的序列条形码。 设计的条码使用可靠且易于解卷积。
【文件预览】：
BarcodeDesigner
----Parameters.pm(2KB)
----designBarcodes.pl(23KB)
----Deconvolve_Barcoded_Sequences.pl(26KB)
----PrimerDesignObjects()
--------PrimerDesign.pm(26KB)
--------PrimerDimerCheck.pm(9KB)
--------TracePhaseShifters.pm(5KB)
--------RestrictionEnzymeCheck.pm(8KB)
--------ReportManager.pm(19KB)
--------BPlite.pm(15KB)
--------BarcodeCritiques.pm(7KB)
--------SequenceStatistics.pm(14KB)
--------ReferenceManager.pm(10KB)
--------TemplateManager.pm(23KB)
--------Primer3Wrapper.pm(12KB)
--------Utilities.pm(21KB)
--------ReadParametersFile.pm(6KB)
--------StutterDetector.pm(12KB)
--------DregWrapper.pm(11KB)
--------PrimerBindingPalindrome.pm(12KB)
--------FuzznucWrapper.pm(9KB)
--------CoverageManager.pm(22KB)
--------Bl2seqWrapper.pm(7KB)
--------PrimerCritiquor.pm(24KB)
--------RepeatScreener.pm(6KB)
--------AmbiguityCodes.pm(8KB)
--------PrimerSpecificity.pm(19KB)
--------LowComplexity.pm(5KB)
--------BLASTWrapper.pm(16KB)
----454Barcode.config(534B)