文件名称:FIAP:完全集成的注释管道-开源
文件大小:2.37MB
文件格式:GZ
更新时间:2024-05-18 13:14:11
开源软件
FIAP(完全集成注释管道)是用Perl编写的快速细菌基因组多线程注释管道,可检测编码蛋白质,tRNA和rRNA(5S,16S和23S)的基因。 FIAP还允许用户包括无限数量的自定义数据库。 此功能非常有价值,因为它允许用户在注释中添加个人“风味”,并针对特定细菌基因组优化过程。 FIAP可以注释单个和多个序列,这使用户可以在一个步骤中注释例如草案基因组重叠群或连接在多Fasta文件中的不同基因组。 FIAP可在所有类似UNIX的操作系统上运行(已在Ubuntu 14.04 LTS和Mac OS 10.9.4上进行了测试)。
【文件预览】:
FIAP
----Manual.pdf(306KB)
----DB_Maker.pl(838B)
----LICENSE(32KB)
----Example()
--------Annotation()
--------Other_DB_1(1KB)
--------MySequences.fas(2.58MB)
--------Other_DB_2(3KB)
--------MyProtDB(1.42MB)
--------5S.DB(2KB)
--------23S.DB(32KB)
--------FIAP_Summary(352B)
--------16S.DB(17KB)
----README(2KB)
----FIAP.pl(21KB)