文件名称:CrossTalkeR:R包做配体受体分析可视化
文件大小:31.59MB
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更新时间:2024-05-19 09:20:02
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CrossTalkeR 詹姆斯·S·纳加1 ,尼尔斯·莱姆库勒2 ,迈克尔·肖布3 ,丽贝卡·施耐德4,5,6 ,伊万·科斯塔1 * 1亚琛工业大学医学院计算基因组学研究所,亚琛,52074德国 2德国埃森大学医院血液学和干细胞移植科 3亚琛工业大学计算机科学系,德国 4亚琛工业大学医学院生物医学工程研究所细胞生物学系,德国北威州52074亚琛Pauwelsstrasse 30 5 Oncode研究所,伊拉斯姆斯医学中心,鹿特丹,3015GD,荷兰 6荷兰鹿特丹伊拉斯姆斯医学中心血液学系,3015GD,荷兰 动机:配体受体(LR)分析允许从单细胞RNA-seq数据表征细胞串扰。 但是,当前的LR方法为区分细胞类型,配体或受体的优先级或表征两种生物学条件之间的串扰变化提供了有限的方法。 结果: CrossTalkeR是用于LR网络的网络分析和可视化的框架。 CrossTalkeR在