【文件属性】:
文件名称:matlab矩阵自动拼接代码-awesome-single-cell:真棒单细胞
文件大小:29KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-19 21:49:53
系统开源
matlab矩阵自动拼接代码真棒单细胞
用于单细胞数据分析的软件包列表(以及开发这些方法的人员),包括RNA-seq,ATAC-seq等。...
引文
软体套件
RNA序列
-
[Python]
-
:anchor:
在数据中查找双峰,单峰和多峰特征
-[R]-ascend是一个R包,其中包含快速,简化的分析功能,这些功能经过优化,可解决单细胞RNA-seq的统计难题。
该软件包结合了新颖且已建立的方法,以提供灵活的框架来执行过滤,质量控制,归一化,降维,聚类,差异表达和广泛的绘图。
-[Python]-考虑到单细胞RNA序列实验的内在特征而开发的聚类算法。
-[R]-单细胞RNA-seq数据的贝叶斯分析。
估计特定于单元格的归一化常数。
技术变异性是根据刺入基因进行量化的。
表达计数的总可变性被分解为技术和生物学成分。
BASiCS还可以识别在两组或更多组细胞之间差异表达/过度分散的基因。
-
[Python]
-
-[R]-BEARscc利用ERCC插入测量来对技术差异进行建模,该技术差异是基因表达的函数以及技术对低表达基因的影响。
-[matlab]-用于大规模单细胞数据的分析框架。
-
[P
【文件预览】:
awesome-single-cell-master
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