文件名称：pyobo:Python一个Python包，用于使用本体，术语和生物医学术语
文件大小：268KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-09 18:53:36
obo ontologies Python
PyOBO 从OBO的角度来看，用于生物学标识符，名称，同义词，外部参照，层次结构，关系和属性的工具。 用法示例 笔记！ PyOBO是胡说八道。 这意味着标识符中没有重复的前缀。 这也意味着所有标识符都是字符串，没有例外。 笔记！ 第一次运行这些文件时，它们必须下载并缓存所有资源。 我们不负责重新分配数据，因此所有脚本都应完全可复制。 如果您没有时间，可以使用一些AWS工具在pyobo.aws托管/下载预编译版本。 笔记！ PyOBO可以在少数情况下执行接地，但这并不是命名实体识别（NER）或接地的通用解决方案。 建议检查的解决方案。 映射标识符和CURIE 获取ChEBI标识符到名称的映射： import pyobo chebi_id_to_name = pyobo . get_id_name_mapping ( 'chebi' ) name = chebi_id_to_nam