文件名称：karect:KAUST Assembly Read纠错工具
文件大小：240KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-04 21:25:15
C++
卡勒克特 KAUST Assembly Read纠错工具 安装 tar -xzf file_name.tar.gz cd karect 制作 指示 要获取所有说明，请运行程序： ./karect 测试数据和运行示例 Karect可以接受汇编读取的任何fasta / fastq文件作为输入： 纠正金黄色葡萄球菌Illumina的论文中使用的运行示例如下： 从以下位置下载文件frag_1.fastq.gz和frag_2.fatstq.gz（如果需要评估结果，请下载基因组.fasta）： 通过以下方式解压缩frag_1.fastq.gz和frag_2.fatstq.gz： gunzip frag_1.fastq.gz gunzip frag_2.fastq.gz 使用Karect纠正读取顺序（如果需要，请修改文件路径）： ./karect -correct -threads = 12 -
【文件预览】：
karect-master
----stack.h(2KB)
----suffixcactus.h(15KB)
----memory_utils.h(2KB)
----errorcorrect.h(44KB)
----LICENSE(18KB)
----edit_dist.h(16KB)
----file_access.h(2KB)
----getreads.h(59KB)
----align.h(27KB)
----karect_manual.pdf(163KB)
----karect.cpp(3KB)
----README.md(2KB)
----suffixfilter.h(33KB)
----errorgraph.h(33KB)
----suffixarray_induced.h(36KB)
----makefile(82B)
----file_block.h(10KB)
----README(2KB)
----evaluate.h(34KB)