Neuroboom:一套用于可视化和分析连接体数据的python工具套件

时间:2024-03-04 18:42:56
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文件名称:Neuroboom:一套用于可视化和分析连接体数据的python工具套件

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更新时间:2024-03-04 18:42:56

Python

神经繁荣 Neuroboom是一套Python 3工具,用于分析Connectomic活动中的神经元重建。 该软件包当前设计用于在CATMAID或Neuprint平台内的神经元重构上运行。 这两个不同的平台反映了果蝇果蝇(Drosophila melanogaster)中两个可用的连接组学工作: Zheng等。 ,2018,细胞 ,Scheffer等。 ,2020年, eLife 我以前看过吗? 在科学论文中已经介绍了Neuroboom软件包中包含的一些代码,其中最重要的是树状图功能: ,J。Felsenberg等。 ,2018,细胞 , N。Otto , MW Pleijzier等。 ,2018,生物学 ,S。Hampel等。 ,2020年, biorXiv 文献资料 Neuroboom正在阅读中 特征 树状图:神经元的二维图形表示。 *提供用于科学论文/制图表达的静态效果


【文件预览】:
neuroboom-master
----MANIFEST.in(362B)
----README.rst(2KB)
----CONTRIBUTING.rst(3KB)
----.gitattributes(35B)
----.flake8(159B)
----neuroboom()
--------connectivity.py(3KB)
--------_version.py(18KB)
--------utils.py(5KB)
--------__init__.py(93B)
--------tests()
--------dendrogram.py(23KB)
--------stats.py(13KB)
--------morphoelec.py(11KB)
----requirements-dev.txt(317B)
----requirements.txt(154B)
----AUTHORS.rst(175B)
----versioneer.py(67KB)
----.travis.yml(2KB)
----LICENSE(1KB)
----setup.cfg(143B)
----setup.py(2KB)
----docs()
--------source()
--------make.bat(797B)
--------Makefile(673B)
--------_config.yml(26B)
----.codecov.yml(178B)
----.gitignore(904B)
----.coveragerc(214B)

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