文件名称：贝岭的matlab的代码-AnHyDeg:用于宏基因组数据集功能基因搜索的厌氧碳氢化合物降解基因数据库
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更新时间：2024-07-06 02:30:43
系统开源
贝岭的matlab的代码 AnHyDeg：一个有氧海兰的策展数据库drocarbon度radation基因 Amy V. Callaghan *和 Boris Wawrik *通讯作者 俄克拉荷马大学 微生物学和植物生物学系，770 Van Vleet Oval, Norman OK 73019 电子邮件： 请引用如下： 卡拉汉、AV 和 B. Wawrik。 2016. AnHyDeg：厌氧烃降解基因的精选数据库。 . 内政部： 微生物对碳氢化合物的厌氧转化有助于缺氧生态系统中的生物地球化学循环和污染环境的生物修复。 在过去的 25 年里，人们对厌氧生物降解过程和必要的生化途径中涉及的遗传机制有了很多了解。 功能基因经常被用作厌氧碳氢化合物代谢环境评估的生物标志物，宏基因组技术极大地增强了我们为这些基因标志物询问财团和环境系统的能力。 然而，由于缺乏对“组学”数据集的人工管理，导致这些基因和蛋白质序列在几个公共数据库中被错误注释。 本文的 GitHub 数据库旨在为构建与厌氧碳氢化合物降解过程相关的序列的高度策划数据库提供一个起点。 此处包含的序列适用于主要参与碳氢化合物厌氧活化的基