文件名称：pasta:PASTA（使用SATe和传递性的实用对齐）
文件大小：1.94MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-18 23:43:08
Python
这是在和 JCB 中发布的 PASTA（使用 Saté 和 TrAnsitivity 的实用对齐）算法的实现： Mirarab S、Nguyen N、Warnow T. PASTA：超大多序列比对。 夏兰河，编辑。 Res Comput Mol Biol。 2014:177-191。 Mirarab S、Nguyen N、Guo S、Wang LS、Kim J、Warnow T. PASTA：核苷酸和氨基酸序列的超大多序列比对。 J 计算生物学。 2015;22(5):377-386。 。 最新版本包括此处描述的新分解技术： Balaban、Metin、Niema Moshiri、Uyen Mai 和 Siavash Mirarab。 “TreeCluster：使用系统发育树聚类生物序列。” BioRxiv, 2019, 591388. doi:10.1101/591388。 接