J-Circos:J-Circus：交互式马戏团绘图仪-开源

【文件属性】：

文件名称：J-Circos:J-Circus：交互式马戏团绘图仪-开源

文件大小：243.82MB

文件格式：ZIP

更新时间：2024-06-19 14:26:01

开源软件

J-Circos 是一种交互式可视化工具，可以绘制 Circos 图形，还可以动态地向图形中添加数据，并使用鼠标悬停显示和放大/缩小功能提供特定数据点的信息。 [e-mail] 请引用 An J、Lai J、Sajjanhar A、Batra J、Wang C 等人。 J-Circos：交互式 Circos 绘图仪。 生物信息学。 2015；31：1463–5

【文件预览】：
J-Circos.v3
----J-Circos.sh(121B)
----manual_jcircos.pdf(1.29MB)
----J-Circos.jar(125KB)
----Data()
--------hg19.chrom.sizes(376B)
--------demo_label1.txt(181B)
--------demo_UCSC_wiggle.plus.bw(61.64MB)
--------cytogenetic_hg18()
--------demo_UCSC_bed_miRNAs.bed(75KB)
--------demo_UCSC_BigBed_miRNAs.bb(63KB)
--------cytogenetic_hg19()
--------hg18.chrom.sizes(399B)
--------demo_Circos_wiggle.txt(356B)
--------demo_Circos_bridge_genefusion_from_Defuse.txt(963B)
--------demo_UCSC_wiggle.plus.wiggle(262.78MB)
--------demo_UCSC_wiggle.minus.bw(59.77MB)
--------demo_text(143B)
--------demo_label2.txt(169B)
--------demo_Circos_bridge.txt(522B)
--------demo_UCSC_wiggle.minus.wiggle(263.12MB)
----lib()
--------java-getopt-1.0.14.jar(58KB)
--------tribble-1.103.jar(293KB)
--------commons-logging-1.0.4.jar(37KB)
--------commons-math3-3.3.jar(1.86MB)
--------libLoci.jar(27KB)
--------VectorGraphics2D-0.9.1.jar(28KB)
--------baselet_batik-awt-util.jar(394KB)
--------guava-13.0.1.jar(1.8MB)
--------sam-1.98.jar(622KB)
--------miglayout-4.0.jar(199KB)
--------log4j-1.2.17.jar(478KB)
--------IGV.jar(27.67MB)
--------xmlgraphics-commons-1.5.jar(588KB)
--------commons-math3-3.6.1.jar(2.11MB)
--------picard-1.98.jar(1.62MB)
----J-Circos.bat(48B)