TTClust:聚类分子动力学轨迹（琥珀色，gromacs，charm，namd，pdb ...）

【文件属性】：
文件名称：TTClust:聚类分子动力学轨迹（琥珀色，gromacs，charm，namd，pdb ...）
文件大小：10.82MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-07 16:14:54
Python TTClust：分子模拟聚类程序 描述 TTclust是用于将分子动力学模拟轨迹聚类的python程序。 它只需要一个轨迹和一个拓扑文件（由于使用了MDtraj包，因此与大多数分子动力学程序包（例如Amber，Gromacs，Chramm，Namd或PDB格式的轨迹）兼容）。 该程序易于使用，可通过树状图生成视觉的聚类反馈。 其他图形表示形式也用于描述所有群集（有关更多详细信息，请参见“输出示例”部分）。 Python兼容性 该程序与python 2.7.x和3.x兼容。 您可以使用python 3.x对matplotlib发出警告，但该程序仍然可以正常工作 ## GUI如果要使用图形用户界面，则可以在ttclustgui之后安装ttclust （使用pip ）。 链接到GUI： : 安装 与Conda一起安装 如果您想轻松安装ttclust，我建议执行以下步骤： 如果您没有安装co

【文件预览】：
TTClust-master
----recipes()
--------meta.yaml(1KB)
----images()
--------ttclust_logo.png(75KB)
--------ttclust-GUI.png(88KB)
----requirements.txt(311B)
----create_envir_with_ttclust.yml(218B)
----ttclust()
--------ttclust.py(48KB)
--------__init__.py(32B)
--------version.py(22B)
----examples()
--------backbone()
--------example.xtc(8.4MB)
--------example.pdb(181KB)
----LICENSE(69KB)
----environment.yml(193B)
----setup.py(1KB)
----README.md(15KB)