Molecular_classification:“用于化学的Auto-sklearn”-训练并运行用于分子分类任务的机器学习分类器

时间:2024-02-27 10:53:31
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文件名称:Molecular_classification:“用于化学的Auto-sklearn”-训练并运行用于分子分类任务的机器学习分类器

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更新时间:2024-02-27 10:53:31

python machine-learning chemistry cheminformatics scikit-learn

分子分类 “ 用于化学”。 总览 训练并运行机器学习的分类器以执行分子分类任务; 例如,预测QSAR项目中的溶解度,雾化能或生物亲和力等属性。 总体目的是“将任何易于计算的东西扔到墙上,看看有什么东西粘在上面”。 分子以字符串的形式输入。 根据这些,可以使用计算不同类型的指纹(固定大小的向量)。 模型训练基于基于或分类。 更先进的表示(例如,图形回旋)或ML模型(例如,深层神经网络)不被支持。 但是,该软件包会针对支持的模型类型自动进行超参数优化。 该项目提供了两个脚本: train_mol_class.py :训练scikit学习或xgboost模型 Forecast_mol_clas


【文件预览】:
molecule_classification-master
----predict_mol_class.py(3KB)
----demo()
--------data_test_dmso_solubility.tsv(55KB)
--------dmso.cfg(280B)
--------demo.sh(1003B)
--------data_train_dmso_solubility.tsv.gz(127KB)
----setup.py(734B)
----README.md(9KB)
----train_mol_class.py(67KB)
----.gitignore(1KB)

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