sequencing_project

时间:2024-04-14 15:40:35
【文件属性】:

文件名称:sequencing_project

文件大小:31KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-04-14 15:40:35

Python

sequence_project 等位基因特异性表达(酶)分析流程 此脚本可自动完成从设置Python到下载参考基因组以及执行DNA和RNA分析以获取有关酶结果的一切操作 要求 平台: linux-64 python> = 3.6 安装和设置说明 打开bash(Unix shell)并输入以下内容: 1.克隆git存档: git clone https://github.com/biomedswe/sequencing_project.git $HOME/sequencing_project 2.运行setup_anaconda3.py并按照程序中的说明进行操作 请注意,您必须先安装python:≥2.7。 Let Anaconda3 install at default location 3.运行main.py并按照程序中的说明进行操作 在外壳中键入以下内容: python3


【文件预览】:
sequencing_project-main
----reference_genome.py(5KB)
----menus.py(18KB)
----main.py(8KB)
----rna_seq_analysis.py(13KB)
----dna_seq_analysis.py(20KB)
----setup_anaconda3.py(7KB)
----excludeTemplate()
--------human.hg38.excl.tsv(82KB)
----Logname.txt(8KB)
----.gitignore(2KB)
----README.md(1KB)

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