文件名称：DNA_FT:DNA序列的傅立叶变换
文件大小：133KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-23 18:17:39
Python
DNA_FT.py脚本将读取输入的fasta文件（在本例中为test.fasta ）中的所有序列，并为每个fasta条目生成傅立叶频谱图。 每个条目的图均以.png文件保存在-o指定的输出目录中。 所有依赖项都包含在dna_ft.yml文件中。 构建并激活conda环境： conda env create -f dna_ft.yml conda activate dna_ft 然后运行DNA_FT.py脚本： python python DNA_FT.py -i test.fasta -o ./output/ 该代码使用以下出版物中概述的方法： Tiwari，S.，Ramachandran，S.，Bhattacharya，A.，Bhattacharya，S.＆Ramaswamy，R.通过基因组序列的傅里叶分析预测可能的基因。 计算应用生物科学。 13，263–270（1997）。
【文件预览】：
DNA_FT-master
----.gitattributes(483B)
----NC_045512.2.fasta(30KB)
----test.fasta(1KB)
----dna_ft.yml(1KB)
----output()
--------test1.png(49KB)
--------test2.png(54KB)
--------NC_045512.2.png(22KB)
----DNA_FT.py(2KB)
----README.md(784B)
----.gitignore(3KB)