文件名称：H-BLAST:异构BLAST（H-BLAST），一种用于将CPU和GPU耦合的异构计算机的快速并行搜索工具，以加速BLASTX和BLASTP – NCBI-BLAST的基本工具
文件大小：332KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-31 18:44:37
C++
异构BLAST（H-BLAST） 异构BLAST（H-BLAST）是用于将CPU和GPU耦合在一起的异构计算机的快速并行搜索工具，以加速BLASTX和BLASTP-NCBI-BLAST的基本模块。 H-BLAST采用局部解耦的种子扩展算法来利用GPU的优势，并提供了一种性能调整机制，可在各种CPU和GPU组合之间实现更高的效率。 H-BLAST产生的对齐结果与NCBI-BLAST相同，并且其计算速度比NCBI-BLAST快得多。 H-BLAST已在不同的软件和硬件设置上进行了测试。 例如，CentOS Linux（v5.4，v6.0和v7.1）和Ubuntu Linux（v11.04）被用作H-BLAST的基准软件平台。 NVIDIA Tesla C2050 GPU卡，NVIDIA Tesla K20 / K40 GPU卡和NVIDIA Geforce GTX 560 GPU卡被用作H
【文件预览】：
H-BLAST-master
----h_blast_v1.1()
--------H-BLAST()
--------install(7KB)
--------runtime_setting_files()
--------new_Makefiles()
--------scripts()
--------README(17KB)
----README.md(2KB)