文件名称：跑步者
文件大小：8KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-08 11:41:29
Python
跑步者 该存储库包含一些附件脚本，用于将KGX生成的节点TSV解析为与兼容的术语列表。 长期目标是为OGER之外的NER工具建立术语列表输入。 KGX TSV的本体 要从您的OBO JSON本体生成TSV， kgx transform ontology.json --input-format obojson --output output --output-format tsv 准备术语表 转换可以如下进行， python runner.py prepare-termlist -i output_nodes.tsv -o termlist.tsv 在文档上运行OGER 您可以按以下步骤对文本文档运行OGER， python runner.py run-oger abstract.txt -t termlist.tsv -o out.json -f bioc_json 注意：此命令
【文件预览】：
runner-master
----biohub_converter.py(3KB)
----.gitignore(2KB)
----requirements.txt(45B)
----stopwords()
--------stopWords.txt(6KB)
----LICENSE(1KB)
----README.md(1KB)
----settings.ini(1KB)
----runner.py(2KB)