文件名称：workflow4metabolomics:Workflow4Metabolomics元存储库
文件大小：12.34MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-16 16:26:37
nmr metabolomics lc-ms galaxy-project workflow4metabolomics
我们的项目 简称W4M的是法国的基础架构，提供软件工具处理，分析和注释代谢组学数据的功能。 它基于Galaxy平台。 在代谢组学（）和生物信息学平台（ ）之间的协作中，我们已经使用Galaxy框架开发了完整的LC / MS，GC / MS和NMR管道，用于数据分析，包括预处理，标准化，质量控制，统计分析和注释步骤。 这些模块化和可扩展的工作流程由现有的组件（XCMS和CAMERA软件包等）组成，还包括一整套互补的自制工具。 可通过Web界面访问此实现，以确保参数的完整性。 Galaxy的高级功能使来自不同来源和不同类型的组件的集成成为可能。 因此，为代谢组学界（平台，最终用户等）提供了可扩展的虚拟研究环境（VRE），使新用户以及本领域专家可以共享预配置的工作流程。 引文 Giacomoni F.，LeCorguilléG.，Monsoor M.，Landi M.，Pericard P.，