文件名称:kmc-rs:与KMC的Rust绑定
文件大小:11KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-02-29 02:39:39
Rust
与KMC API的Rust绑定 访问数据库文件并查询计数。 例 let db = kmc_rs :: KmcFile :: open_ra ( "data/test1" )?; let kmer = kmc_rs :: Kmer :: from ( "TAAGA" )?; assert_eq! (db. kmer_length (), 5 ); // we have an index over 5-mers assert_eq! (db. count_kmer ( & kmer), 4 ); // "TAAGA" (or reverse complement) occurs 4 times
【文件预览】:
kmc-rs-main
----.travis.yml(211B)
----.gitmodules(76B)
----build.rs(247B)
----data()
--------test1.kmc_suf(590B)
--------test1.kmc_pre(108B)
--------test1.fasta(1008B)
----tests()
--------bitstring.hh(311B)
--------test_api.cc(1KB)
--------makefile(277B)
--------test_pyapi.py(1KB)
--------.gitignore(9B)
----src()
--------cxxbridge.rs(1KB)
--------cxxbridge.cc(2KB)
--------lib.rs(9KB)
----Cargo.toml(567B)
----LICENSE.md(1KB)
----.gitignore(8B)
----KMC()
----README.md(551B)