文件名称:kegg-animate-pathway:命令行实用程序以任意颜色为KEGG路径的对象着色
文件大小:2.29MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-11 03:47:58
Python
凯格动画路径 kegg-animate-pathway是基于的命令行实用程序,可与 API交互以产生代谢途径的动画图,以揭示其基因和/或化合物的活性。 这是一个例子: 覆盖层的颜色,大小和模糊可以随意修改。 例如,这是一条相同的路径,但是叠加层被模糊和放大,并使用了蓝色至黄色的调色板: 安装 $ pip install https://github.com/ajmazurie/kegg-animate-pathway/zipball/master 用法 在命令行上使用kegg-animate-pathway ; 选项(通过键入kegg-animate-pathways --help )可用于选择要显示的KEGG途径,用于图形叠加的基因和/或化合物的活性水平,以及用于图形叠加的各种设置,例如尺寸,模糊级别和颜色。 以下是所有这些选项的列表: usage: kegg-animate
【文件预览】:
kegg-animate-pathway-master
----bin()
--------kegg-animate-pathway(27KB)
----.hgtags(135B)
----doc()
--------genes.csv(55B)
--------pathway+blur.gif(1.27MB)
--------pathway+blur+scaling.gif(1.54MB)
--------pathway.gif(2.67MB)
----PROJECT(257B)
----REQUIREMENTS(30B)
----setup.py(1KB)
----Makefile(617B)
----README.md(6KB)