DeepLncLoc：基于深度学习的lncRNA亚细胞定位预测器

【文件属性】：
文件名称：DeepLncLoc：基于深度学习的lncRNA亚细胞定位预测器
文件大小：2.11MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-02-16 05:26:24
Python DeepLncLoc 基于深度学习的lncRNA亚细胞定位预测因子 用法 如何训练模型 您可以通过命令打击以非常简单的方式训练模型： python train.py –k 3 –d 64 –s 64 –f 128 –metrics MaF –device“ cuda：0” k是k-mers功能的值。 d是由gensim库训练的k-mer特征向量的维数。 s是子序列数。 f是CNN层中的过滤器编号。 指标是训练过程中的评估指标。 “ MaF”代表宏f1，“ ACC”代表精度，“ MaAUC”代表宏auc，“ MiAUC”代表微auc。 设备是用于构建和训练模型的设备。 对于cpu可以是“ cpu”，对于gpu可以是“ cuda”，对于gpu 0可以是“ cuda：0”。 您也可以使用我们提供的软件包来训练您的模型。 首先，您需要导入软件包。 from model . utils im

【文件预览】：
DeepLncLoc-master
----Independent_test_set()
--------test_set.txt(621KB)
----train.py(1KB)
----LICENSE.txt(1KB)
----model()
--------utils.py(9KB)
--------DL_ClassifierModel.py(10KB)
--------metrics.py(6KB)
--------lncRNA_lib.py(2KB)
--------nnLayer.py(11KB)
----README.md(3KB)
----cache()
--------README.txt(41B)
----data.txt(6.73MB)
----out()
--------README.txt(44B)