unionplot:组间重叠的维恩式表示

时间:2024-06-01 07:15:24
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文件名称:unionplot:组间重叠的维恩式表示

文件大小:263KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-01 07:15:24

R

并集图就像维恩图一样,它显示了三个组之间的重叠。 与维恩图不同,重叠成员的数量不是由数字表示,而是由为每个成员绘制的点表示,然后可以通过感兴趣的因素对其进行着色。 如果成员太多而无法轻松显示,则每个点可以代表一个以上的成员(如上例所示)。 该程序包旨在显示微生物生态数据(样品中的OTU),但可适用于其他应用。 安装 从GitHub安装unionplot: devtools :: install_github( " wilkox/unionplot " ) 演练 对于任何联合图,您将需要一个至少包含以下列的数据框:-名为“ OTU”的因子列,其中包含OTU(或其他集合成员); -一个因子列,正好包含三个级别,将是图中的三个组; -因子列,通过该列可以为点着色。 并集图仅显示OTU(或其他集合成员)的存在与否,而不显示计数。 任何“计数”或“相对丰度”列都将被忽略。 假定数据帧中包含OT


【文件预览】:
unionplot-master
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--------OTUTable.rda(3KB)
----NAMESPACE(64B)
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--------testthat()
--------testthat.R(62B)
----.Rbuildignore(44B)
----example.png(91KB)
----.gitignore(12B)
----R()
--------data.R(251B)
--------helpers.R(3KB)
--------unionplot.R(12KB)
----DESCRIPTION(436B)
----README.md(2KB)

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