文件名称:geojson-phylogeny:使用 GeoJSON 在地图上显示系统发育
文件大小:229KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-07-05 16:40:43
PHP
GeoJSON 系统发育 受启发,使用 GeoJSON 在地图上显示系统发育。 下面是一组 DNA 条形码的示例,使用可视化。 源 GeoJSON 在。 给定一个包含地理坐标和一组 OTU 分类分配信息的 NEXUS 格式的树文件,我们可以生成一个 GeoJSON 文件,其中包括系统发育、OTU 的位置、将 OTU 连接到它们在系统发育中的位置的线以及,如果多个 OTU 属于同一分类群,则多边形包围该分类群的分布。 参考 Barth, W.、Mutzel, P. 和 Jünger, M. (2004)。 简单高效的双层交叉计数。 J. 图算法应用程序。 图算法与应用杂志。 Robert G Beiko、Donovan H Parks、Timothy Mankowski、Somayyeh Zangooei、Michael S Porter、David G Armanini、Donal
【文件预览】:
geojson-phylogeny-master
----crossing.php(1KB)
----nexus.php(10KB)
----treelib.php(308B)
----tree_drawer.php(14KB)
----service.php(1KB)
----perm.php(928B)
----geojson_tree_drawer.php(24KB)
----node_iterator.php(3KB)
----svg.php(8KB)
----read.php(9KB)
----tree.php(10KB)
----geojson_port.php(6KB)
----make_html.php(2KB)
----node.php(5KB)
----port.php(2KB)
----examples()
--------AMPSA361-13.COI-5P.png(199KB)
--------AMPSA361-13.COI-5P.html(69KB)
--------AMPSA361-13.COI-5P.json(67KB)
--------AMPSA361-13.COI-5P.tre(2KB)
----README.md(2KB)
----make_json.php(355B)