文件名称:gut_virome_db
文件大小:4.37MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-04-19 10:41:52
Perl
gut_virome_db:删除冗余 数据: GVD_sequences.fa: ://datacommons.cyverse.org/browse/iplant/home/shared/iVirus/Gregory_and_Zablocki_GVD_Jul2020/GVD_Viral_Populations/GVDv1_viralpopulations.fna.tar.gz GPD_sequences.fa: ://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/metagenomics/genome_sets/gut_phage_database/GPD_sequences.fa 在run.sh中的完整代码 聚类结果存储在“输出”文件夹中
【文件预览】:
gut_virome_db-main
----blast_cluster.v3.pl(2KB)
----blast_cvg.pl(1KB)
----Output()
--------GVD.i95_c40.uniq(2.68MB)
--------GVD.i95_c50.uniq(2.68MB)
--------GVD.i95_c75.uniq(2.69MB)
--------GVD.i95_c60.uniq(2.68MB)
--------GPD_sequences.sort.len(2.43MB)
--------GVD_sequences.sort.len(1.87MB)
--------GVD.i95_c70.uniq(2.69MB)
----fasta_length(13KB)
----run.sh(3KB)
----split_fa.pl(2KB)
----README.md(414B)
----blast_cluster.v2.pl(2KB)