文件名称：Msc_Digital_Health
文件大小：18.58MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-05 14:44:06
Python
Msc_Digital_Health 该存储库用于介绍基因组_assembly_workshop 课程 ： 打开getting_started.pptx 然后在powerpoint folder ASSEMBLY_WORKSHOP.pptx 。 按照提示进行操作，并在提示时打开其他文件。 剧本 shell scripts文件夹包含您需要的shell。 使用以下命令打开： Notepad++ 。 这是文本编辑器的王者！ Filezilla是用于传输文件的ACE。 享受！ 课程作业 序列化Illumina MiSeq机器输出的原始读数在coursework_reads 从纯培养物中分离出DNA。 您可以将学到的知识应用于以下数据集，并确定它们拥有的知识： 病人 读 病因 Patient_C Patient_C_1.fastq.gz ？ Patient_C Patien
【文件预览】：
Msc_Digital_Health-main
----.nanorc(858B)
----course_work()
--------README.md(743B)
----shell_scripts()
--------blast.sh(1KB)
--------FastQC.sh(620B)
--------scaffold_stats.pl(10KB)
--------trim_assemb_predict_blast_advanced_coding.sh(4KB)
--------predict_genes.sh(753B)
--------trimmomatic.sh(2KB)
--------assembly.sh(2KB)
--------Example.sh(245B)
--------assemble_all_odd_kmers.sh(1KB)
--------spades.sh(758B)
--------Genome_assembly_commands.sh(4KB)
--------read_donwloads.sh(1KB)
--------unicycler.sh(821B)
----I am badly named file.txt(199B)
----Once_the_workshop_is_over()
--------check_primers_against_bacteria.py(2KB)
--------NC_010286.1.pdf(5KB)
--------extra_info_background.docx(87KB)
--------NC_010286.1_circular.pdf(51KB)
--------Plasmid_vs_Mutant_palsmid_see_the_missing_bit.pdf(4KB)
--------primers.txt(82B)
--------assemblies()
----LICENSE(1KB)
----powerpoint()
--------4_Shell_scripting.pptx(980KB)
--------3_basic_UNIX.pptx(850KB)
--------6_assembly.pptx(1.11MB)
--------2_Getting_connected.pptx(476KB)
--------5_qsub.pptx(93KB)
--------Kmers_and_graphs.pptx(2.65MB)
--------1_ASSEMBLY_WORKSHOP.pptx(2.47MB)
--------7_Conda.pptx(756KB)
--------things_to_think_about.txt(1KB)
----genome_diagram()
--------README.rst(2KB)
--------multiple_contigs_DOES_NOT_WORK_for_some()
--------Genome_diagram.py(7KB)
--------Genome_diagram_multi_contigs.py(7KB)
--------rewrite_as_fasta.py(1KB)
----GD5302_Genetics_practical.pdf(82KB)
----unicycler_prerun()
--------Genome_diagram.py(6KB)
--------assembly.fasta(1.01MB)
--------005_polished.gfa(1021KB)
--------PROKKA_10052020.gbk(2.03MB)
----.gitignore(2KB)
----Getting_started.pptx(1.07MB)
----graphs()
--------velvet_k18.zip(4.23MB)
--------velvet_k53.zip(1.86MB)
--------graph_K53.png(72KB)
--------graph_K18.png(263KB)
--------unicycler_graph.png(35KB)
--------unicycler.zip(275KB)
----reads()
--------download.sh(671B)
----README.md(1KB)
----precomputed_assembly_stats()
--------all_assemblies_pre_computed.xlsx(12KB)
--------ALL_ASSEMBLIES.txt(3KB)