文件名称：PyVCF:适用于 Python 的 Variant Call Format 阅读器
文件大小：7KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-01 09:19:01
Python
PyVCF 的开发库位于 ** 适用于 Python 的 VCFv4.0 解析器。 该模块的目的是模仿 Python stdlib 中的csv模块，而不是更灵活的序列化格式，如 JSON 或 YAML。 vcf将尝试根据元信息行中指定的数据类型解析每条记录的内容——特别是 ##INFO 和 ##FORMAT 行。 如果这些行丢失或不完整，它将检查规范中提到的保留类型。 否则，它只会返回字符串。 目前有一个接口： VCFReader 。 它接受一个类似文件的对象并充当读取器： >>> import vcf >>> vcf_reader = vcf.VCFReader(open('example.vcf', 'rb')) >>> for record in vcf_reader: ... print record Record(CHROM='20', POS=14370, ID
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PyVCF-master
----README.rst(3KB)
----LICENSE(1KB)
----vcf.py(15KB)