文件名称：遗传算法源代码matlab程序-Tropix:计算持久性同源性的热带足够统计量的代码
文件大小：781KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-09 09:02:18
系统开源
遗传算法源代码matlab程序持久同源性的热带足够统计量（Tropix） 在此存储库中，我们提供了代码，该代码使用基于热带几何体的欧几里得语空间中的嵌入来为条形码生成稳定的足够统计信息---捕获数据“形状”的拓扑特征的多尺度摘要，但是结构复杂，因此很难在统计设置中使用。 我们将此软件称为Tropix。 此统计充分性结果来自于并允许假设条形码的欧几里得表示形式上具有经典概率分布。 反过来，这使得各种适用于条形码的参数推断方法都可以保持条形码的初始解释。 特别地，这项工作表明可以假定指数族分布，并且可以建立持久同源性的可能性。 在此存储库中，我们使用Tropix从概念上证明了充分性，并说明了其在持久同源性维度0和1中的实用性，以及对HIV和禽流感数据的具体参数应用。 Tropix是在三种不同的语言环境中实现的：（1）Matlab，（2）Python和（3）C ++。 如果可能，我们建议使用C ++或Matlab版本。 Monod等人使用的预处理数据。 （2017）在名为“数据集”的目录中可用。 MATLAB环境 MATLAB是一种多范式数值计算环境，并且是所开发的专有编程语言。 MATLA
【文件预览】：
Tropix-master
----Datasets()
--------Influenza_Alignments()
--------HIV_Alignments()
----LICENSE(34KB)
----Software()
--------Tropix.cpp(4KB)
--------Tropix.py(1KB)
--------Tropix.m(2KB)
----README.md(7KB)