oncoprint:在R中创建Beautilful Oncoprints

时间:2024-05-31 09:04:17
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文件名称:oncoprint:在R中创建Beautilful Oncoprints

文件大小:53KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-05-31 09:04:17

R

联机印刷 安装 直接从GitHub安装: library(devtools) install_github("dakl/oncoprint") 用法 该软件包可用于在R中创建精美的原稿。 library(oncoprint) data(tcga_brca) # vertical x-labels vert_x <- theme(axis.text.x = element_text(angle = 90, hjust = 1, vjust=.5)) oncoprint(tcga_brca) + coord_fixed() + vert_x 主要功能( oncoprint(M) )在这种形式的字符串矩阵上工作: TCGA-BH-A1EV-01 TCGA-A2-A1FW-01 TCGA-AO-A1KS-01 TCGA-D8-A1JB-01 TCGA-D8-A1JD-01 BRC


【文件预览】:
oncoprint-master
----NAMESPACE(31B)
----R()
--------memosort.R(823B)
--------incrementMatrix.R(500B)
--------oncoprint.R(5KB)
----data()
--------tcga_brca.rda(606B)
----.bumpversion.cfg(96B)
----man()
--------oncoprint.Rd(552B)
--------memoSort.Rd(467B)
--------incrementMatrix.Rd(406B)
----README.md(2KB)
----oncoprint-example.png(48KB)
----DESCRIPTION(333B)

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